机电工程系是近年来顺应社会需求在厦门大学重新崛起的高层次的工科院系之一， 现已拥有2个一级学科博士学位授权点( 仪器科学与技术、机械工程)， 5个硕士学位授权点(测试计量技术及仪器、 精密仪器及机械、机械电子工程、机械制造及其自动化、机械设计理论)、2个工程硕士授权点(仪器仪表工程、机械工程)。本科专业设置横跨三个一级学科(仪器科学与技术、机械工程、电气工程)、 多个二级学科。
创办于 1940年秋的机电工程系，是由国际近代著名物理学家、卓越的电机工程学家、杰出教育家、厦门大学前校长萨本栋教授亲手创办起来的。创设时学生数为 9 人，至44 年度学生数猛增至 202人， 是当时厦门大学师资水准最高、对新生最具吸引力的学系，连续几年为厦门大学第一大系。其时同步发展的厦门大学航空工程系是当时全国仅有的四所本科航空学系(清华大学、北洋大学、交通大学、 厦门大学)之一。厦门大学为国内首次设置机电工程系与航空学系的院校。机电工程系因发展迅猛48 年又分为机械工程系和电机工程系。三系在 52---53 年全国院、系调整时分别并入清华大学、浙江大学、 南京工学院、北京航空航天大学、南京航空航天大学。上述院校机电工程、航空工程方面创建初期骨干师资、优质生源有相当部分源自厦门大学。早期机电工程系、航空工程系办学成绩斐然，毕业10届学生遍 布世界各地，不少系友成为享誉世界的杰出英才。中国两院院士艾兴、张启先、闵桂荣、阙端麟，国际电机及电子学会院士葛文勋、苏林翘，台湾新竹科学工业园区创始人、杰出教育家、实业家何宜慈， 中国工程院院士陈一坚，印尼著名实业家邵建寅等是这期间系友中的佼佼者。
厦门大学机电工程系，源清脉长，系友情谊连绵不断，专业选择、发展前景开阔明朗，极易伸张。由于厦门经济特区的创立急需工科人才，于是 1983 年教育部批准厦门大学增设科学仪器工程专业开始筹办， 同年科学仪器工程系即告成立，并开始招收科学仪器工程专业本科生、硕士生。 1990 年我系获分析仪器专业硕士学位授予权， 1991 年专业调整我系更名为科学仪器与精密机械系(简称科仪系)， 1994 年 增设本科机械电子工程专业。现按教育部及社会需求，结合我系发展潜力与方向、专业的压缩调整及专业名称的规范化，本科专业设置为测控技术及仪器，机械设计制造及其自动化、飞机器动力工程三个专业。 1994 年至 1998 年在海内外校友积极倡导下，在中央、省、地、市共建良好氛围中，厦门大学萨本栋微机电研究中心、厦门太古飞机工程有限公司厦门大学培训中心相继成立。借此东风， 1998 年 12 月我系正 式复名为机电工程系(简称机电系)。
机电工程系办学理念全新，思路清晰，顺应时代需求，办学形式严谨认真、灵活多样。随着形势的发展、学科建设的拓宽，省、市级学术团体(福建省航空学会、厦门市仪器仪表学会、厦门市工程图学学会) 相继挂靠我系。
七十三年，经过数代人的共同奋斗，机电工程系已发展成为师资力量雄厚、学术梯队健全、科研成果丰硕、教学质量较高、在全国有一定影响的人才培养基地。
机电工程系：http://jdx.xmu.edu.cn/index.asp
