安捷伦科技公司近日推出了它的用于分析基因组调控区域活动的CHIP-on-chip芯片平台。真核生物的基因组DNA以染色质的形式存在，因此，研究蛋白质与DNA在染色质环境下的相互作用是阐明真核生物基因表达机制的基本途径。染色质免疫沉淀技术（chromatin immunoprecipitation assay, CHIP）是目前唯一研究体内DNA与蛋白质相互作用的方法。
它的基本原理是在活细胞状态下固定蛋白质－DNA复合物，并将其随机切断为一定长度范围内的染色质小片段，然后通过免疫学方法沉淀此复合体，特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段，通过对目的片断的纯化与检测，从而获得蛋白质与DNA相互作用的信息。CHIP不仅可以检测体内反式因子与DNA的动态作用，还可以用来研究组蛋白的各种共价修饰与基因表达的关系。CHIP与其他方法的结合，可以扩大了其应用范围，如CHIP与基因芯片相结合建立的CHIP-on-chip方法已广泛用于顺式作用因子的高通量筛选。
这项技术对于大规模挖掘这类顺式调控信息成绩卓著。小鼠、大鼠等其他模式生物全基因组测序的完成，促进了人类基因组研究的进程。如今，比较基因组学(comparative genomics)策略不仅可用来精确的预测编码基因，还可用于高通量寻找这部“天书”中大量的顺式调控序列。同时它可以用于胚胎干细胞和一些疾病如癌症、心血管疾病和中央神经系统紊乱等发生的机制。研究人员还可以利用这项技术开发一些治疗方法。
