用生物技术改进树木性质：美国Michigan技术大学最近报导了通过因基工程包括木素的生物合成对树木进行改性，可降低杨树中木素含量45％，而纤维素含量较高，可达到75％，这种改性杨木有利于制浆造纸，而且树木的生长速率明显提高。
用酶脱除木材中的树脂：早期应用酶脱除木材中的树脂是在制浆前，用酶处理木材能降低树脂含量。某工厂用酶处理后贮存1个月的木材中，树脂含量为0.72％，贮存7个月的为0.35％。但是降低了木材白度，贮存1个月的木材白度为57.5％(ISO)，贮存7个月的木材白度降至52.5％(ISO)，木材得率降低，并且需要贮存场地，增加投资费用。
生物机械制浆：磨浆前用酶处理木片，可节约预热木片磨木浆能耗。芬兰用酶处理来自第一段磨浆得到的粗浆，采用纤维素酶处理粗浆2－4h，可节约第二段磨浆能耗15％－20％。
酶应用于漂白：用酶预处理硫酸盐浆，能降低氯耗量和可吸附有机卤化物(AOX)的排放量。此外，可提高纸浆白度。用木聚糖酶处理的条件一般为pH8和温度65℃。美国Georgia大学采用木聚糖酶预处理氧脱木素后的阔叶木硫酸盐浆(pH10和温度90℃)，用DoED1ED2顺序漂白纸浆，最终白度可达90.5％(ISO)，而不用木聚糖酶预处理，纸浆最终白度为86.7％(ISO)。虽然木聚糖酶用量为55IU/g干浆，比工厂正常用量要高，但是，经木聚糖酶预处理后的纸浆，可降低二氧化氯用量25％。芬兰用木聚糖酶处理北方针叶木硫酸盐浆pH为10－10.3，温度为65℃。
用酶进行废纸脱墨：欧洲某工厂用混合酶(含木聚糖酶、甘露聚糖酶、淀粉酶和脂肪酶)结合非离子型表面活性剂，对100％化学木浆涂布纸废纸进行脱墨，比常规方法使用化学药品脱墨更加有效。采用酶对废纸脱墨，可以明显地降低脱墨后浆料的尘埃、纤维束，并能提高浆料的白度。
用酶处理工厂废水：最近研究报导应用酶处理废水中溶解物质和胶体物质，效果很好。芬兰研究发现4种类型酶(脂肪酶、甘露聚糖酶、漆酶和果胶酶)，对存在于木材机械制浆工艺用水中的抽提物和木素能产生明显的作用。(1)脂肪酶能改变抽提物的化学组成，使纤维表面更具亲水性，从而使纸浆强度较高，并能提高树脂在循环工艺用水中的溶解度。(2)甘露聚糖酶能引起树脂对纤维的不稳定性和粘附作用，致使纸浆强度降低，并影响脂肪酶的效用，而抽提物的亲水性和定位对于纸浆强度是很重要的(3)漆酶能聚合存在于预热木片磨木浆工艺用水中的低分子量木素，并能部分氧化亲油性抽提物。(4)果胶酶能降低处理工艺用水时阳离子聚合物的需要量。
