南水北调工程仿真系统建设由中国航天科工集团北京仿真中心下属的仿真技术应用国家工程研究中心承担，该中心技术负责人杨方廷博士接受本社记者专访时称，南水北调事关国计民生，是一项庞大而复杂的系统工程，工程进入实施阶段后将很难逆转与改变，因而需要保证其决策过程的科学性、合理性和可行性。
杨方廷说，仿真能提供一个不同环境的研究系统，具有安全、经济、可控、便于观测、无破坏性、可多次重复等特点，可以对各种决策的效果与作用进行分析比较，以作出科学合理的选择。“为南水北调建立的仿真系统，无疑是该工程决策时的智囊。”
南水北调已基本形成东、中、西三条调水线路。杨方廷介绍说，二000年底，仿真技术应用国家工程研究中心启动南水北调数字仿真平台建设，目前已先后完成东中线水调度、环境污染对调水水质影响的仿真试验，并建立三维视景系统和分析系统。而西线工程仿真正在研讨中。
这位年轻的仿真技术专家指出，南水北调工程仿真系统以建立水量、水价、投资、经济影响四者关系为基础，向工程提供数字仿真平台，让决策者通过工程虚拟场景的一套可视化系统，对工程全貌有更加明了的认识，同时配合仿真结果分析，以方便决策者直观地理解各种工程方案并进行决策。
杨方廷表示，南水北调数字仿真平台的决策支持作用，还表现在建立污染控制模型，验证治污规划；对南水北调东、中线工程水价的制定及其影响给予评价，包括研究水价的直接与次生效应、分阶段水价制定原则和策略、预言水价对国民经济的影响等。
北京仿真中心是中国仿真技术领域唯一的国家重点实验室和仿真技术应用国家工程研究中心，其航天仿真技术在中国重大型号系统、卫星运载工具、载人航天工程中，已成为研制阶段的法定环节。一九九八年至一九九九年，该中心完成引黄入晋工程全系统运行仿真并成功实施。杨方廷透露，该中心除南水北调工程外，还在同步建设滇池污染治理等多项工程的仿真系统平台。
