血气分析仪不吸样故障发生时，首先观察吸排泵P2是否转动，若转动而样品未吸入，故障原因是吸样通道管路脱开或堵塞，包括微型阀堵塞或位置不对，此时首先可检查吸样通道完整性，并作相应处理。若仍不吸样，可拆开三通GT的下端接管，清洁样品箱外的进样通道，包括进样针。若故障仍存在，提示微型阀采样通道内堵或位置偏移，此时打开样品箱，取出微型阀进行清洁去堵处理可排除故障。
不吸样故障还有可能是抽吸、排液泵不工作所致，此时需检查泵及相应电路并进行处理。引起此故障的原因较多，先打开主机箱，查看蠕动泵泵管有无老化破损，如有破损，更换泵管，更换后要重新调节泵管的松紧程度和进行质控标定。如无破损，则检查硅胶管位于电磁阀里的部分是否破损，更换已破损的管道。
另外，以上检查未能发现问题或血气分析仪未能恢复正常时应用故障辅助诊断软件检查：在系统主选单下，测试并观察蠕动泵的正反转是否正常，依次对电磁阀进行检查，看是否有打开和关闭动作情况，电磁阀全部都不工作，首先检查有无28V、45V直流供电，如无供电则测量稳压块或整流二极管是否损坏；电磁阀单个不工作，此故障一般为驱动三极管及控制固态继电器损坏，先检测驱动三极管基极有无驱动信号，如果有，则测量三极管和固态继电器，有损坏则更换。蠕动泵电机不能正转向或反向转动，检测驱动三极管基极是否有驱动信号和三极管的好坏，无驱动信号一般是模/数转换至驱动板断线，有信号时则是三极管坏。
在血气分析仪三极管正常的情况下，检测继电器是否已坏，及时更换。蠕动泵电机根本不能转动，检查电压是否正常、电机或电机电容器是否损坏，如有损坏更换。泵不工作的常见原因还有：进样针检测器引脚霉断，系统不知进样针抬起，按SAMPLE键，泵自然不工作，此时可小心焊接引脚或可用国产光电检测器代用。
